Не совпадают сетки в большинстве случаев - например.

Документ 500х500, к Pixel Grid направляющие и шейпы прилипают четко, но стоит включить Grid (ctrl+') как видно расхождение (включаю, что бы таскать узловые точки шейпа, которые прилипают куда не нужно без Grid, а если не включать - точно попасть в пиксели сложно).

Подгоняю одну к другой потянув за начало координат - все становиться на место, прилипает как надо, но стоит на 200-300 пикселей в любую сторону отодвинуться, как опять видно расхождение...

wtf?

Попробуйте заменить points на pixels и обе еденицы на четвёрки.
Насчёт второго не уверена, возможно, это уже вопрос личного удобства.

Shama, спасибо! разобрался, действительно линейка в пикселях, а сетка в поинтах...